Page tree
Skip to end of metadata
Go to start of metadata

Članak u XML formatu prema standardu JATS se sastoji od deklaracije sheme i 3 razine.

 

 Deklaracija sheme
 Deklaracija (obavezno)
Napomena
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD 
with MathML3 v1.1 20151215//EN " 
"https://jats.nlm.nih.gov/publishing/1.1/JATS-journalpublishing1.dtd">
<article article-type="research-article" xml:lang="en" dtd-version="1.1" 
xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" 
xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">

Vrijednosti atributa article-type:

  • Bibliografija / bibliography
  • Crtice / in-brief
  • Esej / essays
  • In memoriam, Nekrolog / in memoriam, obituary
  • Ispravak / correction
  • Izlaganje sa skupa / conference-paper
  • Izvorni znanstveni članak / research-article
  • Kazalo / index
  • Kratko priopćenje / brief-report
  • Ostalo / other
  • Pismo uredniku / letter
  • Pregledni rad / review-article
  • Prethodno priopćenje / preliminary-communication
  • Recenzija, prikaz / book-review
  • Sažetak sa skupa / abstract
  • Stručni rad / review-article
  • Uvodnik / editorial
  • Vijest / news
  • Zahvala / acknowledgement
  • Životopis / biography
 Front
 Podaci o časopisu

Podaci o časopisu upisuju se u XML jednom i više ih nije potrebno mijenjati (osim ako se neki od navedenih podataka ne promijeni)

Podatak

Obaveznost
polja

JATS XML element

Napomena

Objašnjenje elementa

 

DOI

 

 

Obavezno

<journal-id journal-id-type="doi">DOI casopisa</journal-id>

(warning) Identifikator časopisa je obavezan element zapisa! U ovom primjeru identifikator časopisa je DOI, no može biti i neki drugi identifikator. U slučaju da se zapisuje drugi identifikator, potrebno je promijeniti vrijednost atributa journal-id-type.

Ako identifikatora časopisa nema, u zapisu je potrebno ostaviti prazan element: <journal-id/>

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/journal-id.html

 

Naziv časopisa

 

 

Obavezno

<journal-title-group>
	<journal-title xml:lang="hr">Glavni stvarni naslov casopisa</journal-title>
	<journal-subtitle xml:lang="hr">Glavni stvarni podnaslov casopisa</journal-subtitle>
	<trans-title-group xml:lang="en">
		<trans-title>Usporedni stvarni naslov casopisa</trans-title>
		<trans-subtitle>Usporedni stvarni podnaslov casopisa</trans-subtitle>
	</trans-title-group>
	<abbrev-journal-title>Skraceni naziv casopisa</abbrev-journal-title>
</journal-title-group>

 

(info) Vrijednosti atributa xml:lang:
ISO 639-1 https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php


(warning) U ovom primjeru je naveden zapis svih naslova časopisa koji se mogu zapisati u Hrčku. Obavezno je zapisati samo Glavni stvarni naslov, a zapisi ostalih naslova su opcionalni.

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/journal-title-group.html

 

ISSN / e-ISSN

 

 

Obavezno

<issn pub-type="ppub">ISSN</issn>
<issn pub-type="epub">e-ISSN</issn>

 

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/issn.html

 

Podaci o izdavaču

 

 

Obavezno

<publisher>
	<publisher-name xml:lang="hr">Izdavac hr</publisher-name>
	<publisher-name xml:lang="en">Izdavac en</publisher-name>
	<publisher-loc>Adresa izdavaca
		<email xlink:href="email@email.com">E-mail izdavaca</email>
		<ext-link xlink:href="webadresaizdavaca.com">webadresaizdavaca.com</ext-link>
	</publisher-loc>
</publisher>

 

(info) Vrijednosti atributa xml:lang:
ISO 639-1 https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/publisher.html

 Podaci o članku

Podatak

Obaveznost
polja

JATS XML element

Napomena

Objašnjenje elementa

 

Identifikator / DOI članka

 

 

Opcionalno

<article-id pub-id-type="doi">DOI clanka</article-id>

(warning) U ovom primjeru identifikator članka je DOI, no može biti i neki drugi identifikator. U slučaju da se zapisuje drugi identifikator, potrebno je promijeniti vrijednost atributa pub-id-type.

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/article-id.html

 

Vrsta rada

 

 

Obavezno

<article-categories>
	<subj-group subj-group-type="heading" xml:lang="hr">
		<subject>Vrsta rada</subject>
	</subj-group>
	<subj-group xml:lang="en" subj-group-type="heading">
		<subject>Vrsta rada na engleskom</subject>
	</subj-group>
</article-categories>

(info) Vrijednosti atributa xml:lang:
ISO 639-1 https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php

(info) Vrijednosti elementa subject:

  • Bibliografija / Bibliography
  • Crtice / Reminescences
  • Esej / Essays
  • In memoriam, Nekrolog / In memoriam, obituary
  • Ispravak / Erratum
  • Izlaganje sa skupa / Conference paper
  • Izvorni znanstveni članak / Original scientific paper
  • Kazalo / Index
  • Kratko priopćenje / Short communication, Note
  • Ostalo / Other
  • Pismo uredniku / Letter to the Editor
  • Pregledni rad / Review article
  • Prethodno priopćenje / Preliminary communication
  • Recenzija, prikaz / Book Review
  • Sažetak sa skupa / Meeting abstract
  • Stručni rad / Professional paper
  • Uvodnik / Editorial
  • Vijest / News
  • Zahvala / Acknowledgement
  • Životopis / Biography

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/article-categories.html

 

Naslov rada

 

 

Obavezno

<title-group>
	<article-title xml:lang="hr">Naslov clanka</article-title>
	<trans-title-group>
		<trans-title xml:lang="en">Naslov clanka na drugom jeziku</trans-title>
	</trans-title-group>
</title-group>

 

(info) Vrijednosti atributa xml:lang:
ISO 639-1 https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php

(warning) Naslov članka na drugom jeziku nije obavezno upisivati.

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/title-group.html

 

Podaci o autorima (uključujući afilijacije)

 

 

Obavezno

<contrib-group>
	<contrib contrib-type="author">
		<name>
			<surname>Prezime autora</surname>
			<given-names>Ime autora</given-names>
		</name>
		<email xlink:href="email@email.com">Email autora</email>
		<xref ref-type="aff" rid="aff1">1</xref>
	</contrib>
	<aff>
		<institution xml:lang="hr">Afilijacija (naziv ustanove na hrvatskom)</institution>
        <institution xml:lang="en">Afilijacija (naziv ustanove na engleskom)</institution>
        <addr-line>Adresa ustanove</addr-line>
	</aff>
</contrib-group>

 

Autor koji je istaknut kao kontakt osoba:

<contrib-group>
	<contrib contrib-type="author" corresp="yes">
		<name>
			<surname>Prezime autora</surname>
			<given-names>Ime autora</given-names>
		</name>
		<xref ref-type="contrib" rid="cor1">*</xref>
		<xref ref-type="aff" rid="aff1">1</xref>
	</contrib>
	<aff>
		<institution xml:lang="hr">Afilijacija (naziv ustanove na hrvatskom)</institution>
        <institution xml:lang="en">Afilijacija (naziv ustanove na engleskom)</institution>
        <addr-line>Adresa ustanove</addr-line>
	</aff>
</contrib-group>

 

(warning) Atribut corresp="yes" dodaje se samo ako je autor ujedno i kontakt za dopisivanje.

Za svakog autora je potrebno dodati element <contrib> i sve pod-elemente.

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/contrib-group.html

 

Podaci o autorima za dopisivanje
(corresponding author)

 

Opcionalno

<author-notes>
	<corresp id="cor1">
		<label>*</label>
		Kontakt autor (ime, prezime, institucija, adresa) 
		<email xlink:href="email@email.com">Email autora</email>
	</corresp>
</author-notes>

 

(warning) Ovdje se upisuju podaci o načinima i osobama za dopisivanje. Primjerice, ovdje se navode podaci kako kontaktirati autora koji je prethodno označen kao corresp="yes"

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/author-notes.html

 

Datum objave

 

Obavezno

<pub-date>
	<day>DD</day>
	<month>MM</month>
	<year>YYYY</year>
</pub-date>
 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/pub-date.html

 

Volumen

 

Obavezno, ako postoji

 <volume>Volumen/svezak</volume>
 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/volume.html

 

Broj

 

Obavezno, ako postoji

 <issue>Broj/svescic</issue>
 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/issue.html

 

Početna stranica

 

Obavezno

 <fpage>Pocetna stranica</fpage>
 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/fpage.html

 

Posljednja stranica

 

Obavezno

 <lpage>Posljednja stranica</lpage>
 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/lpage.html

 

Datum zaprimanja, prihvaćanja, recenzije

 

Obavezno, ako postoje

<history>
	<date date-type="received">
		<day>DD</day>
		<month>MM</month>
		<year>YYYY</year>
	</date>
	<date date-type="accepted">
		<day>DD</day>
		<month>MM</month>
		<year>YYYY</year>
	</date>
	<date date-type="revised">
		<day>DD</day>
		<month>MM</month>
		<year>YYYY</year>
	</date>
</history>

 

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/history.html

 

Podatak o licenciji

 

Obavezno

<permissions>
	<license license-type="open-access" xlink:href="URI licencije">
		<license-p>Naziv licencije, npr. CC-BY</license-p>
	</license>
	<license license-type="open-access" xml:lang="hr">
		<license-p>Uvjeti korištenja (tekst) na hrvatskom</license-p>		
	</license>			
	<license license-type="open-access" xml:lang="en">
		<license-p>Uvjeti korištenja (tekst) na engleskom</license-p>
	</license>
</permissions>

 

(warning) Ako časopis ne objavljuje pod određenom CC licencijom, potrebno je izbaciti prvi element gdje se zapisuje podatak o nazivu CC licencije.

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/permissions.html

 

Sažetak

 

Obavezno

<abstract xml:lang="hr">
	<p>Kratak sadrzaj</p>
</abstract>
<trans-abstract xml:lang="en">
	<p>Kratak sadrzaj na drugom jeziku</p>
</trans-abstract>

 

(info) Vrijednosti atributa xml:lang:
ISO 639-1 https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/abstract.html

 

Ključne riječi

 

Obavezno

<kwd-group xml:lang="hr">
	<kwd>Kljucna rijec</kwd>
	<kwd>Kljucna rijec2</kwd>
</kwd-group>
<kwd-group xml:lang="en">
	<kwd>Kljucna rijec na drugom jeziku</kwd>
	<kwd>Kljucna rijec na drugom jeziku2</kwd> 
</kwd-group>

 

(info) Vrijednosti atributa xml:lang:
ISO 639-1 https://www.loc.gov/standards/iso639-2/php/code_list.php

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/kwd-group.html

 

Podaci o projektu

 

Obavezno, ako je rad financiran u projektu

<funding-group>
	<award-group>
		<funding-source source-type=“acronym“>acronym</funding-source>
		<funding-source source-type=“project“>project
name</funding-source>
		<funding-source source-type=“funding
organization“>funding organization</funding-source>
		<funding-source source-type=“funding programme“>funding
programme</funding-source>
		<funding-source soutry-type=“jurisdiction“>jurisdiction</funding-source>
		<award-id>code</award-id>
	</award-group>
</funding-group>

 

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/funding-group.html

 Body

U elementu <body> unosi se cjelovit tekst rada.

  • Cjelovit se tekst rada dijeli po odjeljcima/section (npr. intro, methods, results, discussion)
  • Unutar odjeljaka tekst se dijeli na paragrafe

 

 Podatak

Obaveznost polja

JATS XML element

Napomena

Objašnjenje elementa

 

Cjeloviti tekst

 

Obavezno

<body>
	<sec sec-type="intro">
		<label>Uvod</label>
		<p>Tekst uvoda.</p>
	</sec>
	<sec sec-type="methods">
		<label>Metode</label>
		<p>Metode korištene u izradi rada.</p>
	</sec>
	<sec sec-type="results">
		<label>Rezultati</label>
		<p>Tekst rezultata</p>
	</sec>
	<sec sec-type="discussion">
		<label>Rasprava</label>
		<p>Tekst</p>
	</sec>
</body>

 

Ovo je primjer jednostavnog cjelovitog teksta bez slika, tablica i referenci.

 

Preporučene vrijednosti atributa sec-type:

  • cases
  • conclusions
  • discussion
  • intro
  • materials
  • methods
  • results
  • subjects
  • supplementary-material

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/body.html

 

  • Tablice se unose kao skup elemenata koji definiraju izgled, položaj i sadržaj tablice

Podatak

JATS XML element

Napomena

Objašnjenje elementa

 

Tablica

<p>   
	<table-wrap position="float">               
		<label>Tablica 1</label>
		<caption><title>Ovo je duži naziv tablice</title>
			<p>Ovo je kratak opisni tekst uz tablicu</p>
		</caption>
		<table border="1" width="50%" frame="box">
			<thead>
				<tr>
					<th rowspan="2" align="center" colspan="1" valign="middle">Zaglavlje1</th>
					<th colspan="2" align="center">Zaglavlje 2</th>
				</tr>
				<tr>
					<th align="center">Naslov 1</th>
					<th align="center">Naslov 2</th>
				</tr>
			</thead>
			<tbody>
				<tr>
					<td rowspan="2" valign="middle">Zajednički podatak</td>
					<td align="center">Prvi podatak</td>
					<td align="center">Drugi podatak</td>
				</tr>
				<tr>
					<td align="center">Treći podatak</td>
					<td align="center">Četvrti podatak</td>
				</tr>
			</tbody>
		</table>
	</table-wrap>
</p>

 

Ovo je primjer jednostavne tablice sa četiri reda.

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/table-wrap.html

 

  • Slike, grafike, fotografije, figure se u XML-u navode na način da se navede poveznica na njih

Podatak

JATS XML element

Napomena

Objašnjenje elementa

 

Slika (image)

<p>
	<graphic xlink:href="http://graphicslearning.com/content/uploads/edd/gl-flower-01.png"/>
</p>

Ova linija XML-a prikazat će sliku koja se nalazi na navedenoj adresi na web-u. U člancima se kao vrijednost atributa xlink:href navodi ime slike koja se dostavlja zasebno.

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/graphic.html

 

  • Formule i jednadžbe unose se u programskom jeziku LaTeX ili MathML
PodatakJATS XML elementNapomenaObjašnjenje elementa
Formula / jednadžba

LaTeX

<disp-formula>
  <tex-math notation="LaTeX">
  <![CDATA[
   \(x^2 + y^2 = z^2\)
  ]]>
   </tex-math>     
</disp-formula>

 

MathML

        <disp-formula>
          <mml:math>
            <mml:msup>
              <mml:mi>x</mml:mi>
              <mml:mn>2</mml:mn>
            </mml:msup>
            <mml:mo>&#xA0;</mml:mo>
            <mml:mo>+</mml:mo>
            <mml:mo>&#xA0;</mml:mo>
            <mml:msup>
              <mml:mi>y</mml:mi>
              <mml:mn>2</mml:mn>
            </mml:msup>
            <mml:mo>&#xA0;</mml:mo>
            <mml:mo>=</mml:mo>
            <mml:mo>&#xA0;</mml:mo>
            <mml:msup>
              <mml:mi>z</mml:mi>
              <mml:mn>2</mml:mn>
            </mml:msup></mml:math>
          
        </disp-formula>

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/disp-formula.html

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/mml-math.html

 

  • Liste (popis definicija, popis pojmova po numeraciji, bullet liste...) se unose kao skup elemenata koji definiraju vrstu liste, izgled i sadržaj liste
PodatakJATS XML elementNapomenaObjašnjenje elementa
Lista
Jednostavna lista s definicijama
<p>
	<list>
		<label>Lista 1</label>
		<title>Lista s definicijama</title>
		<list-item>
			<def-list>
				<term-head>Pojam definicije</term-head>
				<def-head>Definicija</def-head>
				<def-item>
					<term>Vrijednost</term>
					<def>
						<p>Pojašnjenje vrijednosti</p>
					</def>
				</def-item>
			</def-list>
		</list-item>  
	</list>
</p>

Jednostavna bullet lista
<p>
	<list list-type="bullet">
		<label>Lista 2</label>
		<title>Bullet lista</title>
		<list-item>
			<p>Prvi bullet</p>
		</list-item>
		<list-item>
			<p>Drugi bullet</p>
		</list-item>
	</list>
</p>

 Vrijednosti atributa list-type:

  • order
  • bullet
  • alpha-lower
  • alpha-upper
  • roman-lower
  • roman-upper
  • simple
 https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/list.html

 

  • Svaku referencu u tekstu je potrebno zasebno označiti

 Podatak

JATS XML element

Napomena

Objašnjenje elementa

 

Reference

<body>
	<sec sec-type="other">
		<label>Species</label>
		<p>There may be species specific differences in energy allocation and biomass gain in 
			relation to activity.<xref ref-type="bibr" rid="r1">1</xref>
		</p>
	</sec>
</body>
<back>
<ref id="r1">
<label>1</label>
<mixed-citation publication-type="journal">
<name><surname>Khan</surname><given-names>J.R.</given-names></name>. 
<article-title>Accommodating the cost of growth and swimming in fish</article-title>.
<source>Frontiers in physiology</source>, 
<volume>5</volume>;
<issue>448</issue>:
<fpage>48</fpage>-<lpage>63</lpage>. <pub-id pub-id-type="doi">10.3389/2014.00448</pub-id>
</mixed-citation>
</ref>

 

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/xref.html

 Back
Unutar elementa <back> zapisuju se sljedeći podaci:
  • bibliografija, zahvale, dodaci

PodatakObaveznost poljaJATS XML elementNapomenaObjašnjenje elementa
Bibliografija / popis literatureObavezno

Članak

<ref-list>
	<ref id="r1">
		<label>1</label>
		<mixed-citation publication-type="journal">
			<person-group person-group-type="author">
				<name>
					<surname>Prezime</surname>
					<given-names>Ime</given-names>
				</name>
			</person-group>
			<date date-type="pub">
				<year>Godina</year>
			</date>.
			<article-title>Naslov članka</article-title>.
			<source>Izvor (časopis)</source>,
			<volume>Volumen</volume>,
			<issue>Broj</issue>
			<fpage>Početna stranica</fpage>-<lpage>Posljednja stranica</lpage>. 
			<pub-id pub-id-type="doi">ID publikacije</pub-id>
			<ext-link ext-link-type="uri" xlink:href="URL"/>
		</mixed-citation>
	</ref>
</ref-list>

Knjiga

<ref id="r2">
	<label>2</label>
	<mixed-citation publication-type="book">
		<person-group person-group-type="author">
			<name>
				<surname>Prezime</surname>
				<given-names>Ime</given-names>
			</name>
		</person-group>. 
		<source>Knjiga</source>. 
		<publisher-loc>Mjesto izdavanja</publisher-loc>: <publisher-name>Izdavac</publisher-name>, 
		<date date-type="pub">
			<year>Godina</year>
		</date>.
	</mixed-citation>
</ref>

Raspored elemenata zapisa nije propisan JATS standardom; svaki časopis može odrediti vrstu podataka i raspored elemenata unutar bibliografskog zapisa prema stilu citiranja koji koristi!

 

 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/ref-list.html

Podatkovni setObavezno, ako postoji

Podatkovni set koji se koristi prilikom izrade rada citira se u popisu referenci kao i ostali izvori. Podatkovni setovi se citiraju unutar elementa <mixed-citation>, gdje se upisuju elementi reference koji u slučaju različitih podatkovnih setova mogu biti različiti te je na uredništvima da definiraju koje elemente će zapisivati.

Preporučuje se zapisati što više elemenata o podatkovnom setu!

 

Zapis podatkovnog seta mora sadržavati sljedeće elemente:

  • Identifier - <pub-id>
  • Title - <data-title> - primarni naslov; <source> - izvor podataka, ako je potrebno hijerarhijski prikazati naziv
  • Author/Creator - <collab> ili <name>
  • Publisher/Distributor/Repository - <publisher>
  • Publication Date/Year/Release Date - <date> ili <year>
  • Version - <version> ili <edition>
  • Resource Type - @publication-format
  • Location of publisher - <publisher-loc>
  • Access date - <date-in-citation content-type=“access-date“>
  • Additional URI/location - <ext-link>


Redoslijed elemenata ovisi o stilu citiranja koji se koristi u časopisu.

Primjer:

<ref id="r3">
	<label>3</label>
	<mixed-citation publication-type="data" publication-format="electronic">
		<collab>Vlasnik/autor podataka</collab>
		<pub-id>Identifikator</pub-id>
		<data-title>Naslov podatkovnog seta</data-title>
		<date>
			<year>Godina</year>
		</date>
		<source>Izvor</source>
		<version>Verzija</version>
		<date-in-citation content-type="access-date">
			<!-- Datum pristupanja -->
			<year>Godina</year>
		</date-in-citation>
		<ext-link ext-link-type="uri">Vanjski link</ext-link>                  
	</mixed-citation>
</ref>

 

 

Element <mixed-citation> mora imati atribut publication-type="data"

Ako su autori/vlasnici/održavatelji podatkovnog seta pojedinačne osobe, zapisuju se u element <person-group person-group-type="curator">

U element <version> može se dodati atribut designator uz kojeg se zapisuju brojčane vrijednosti verzije ili izdanja, npr:
<version designator="2">2nd version</version>

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/chapter/tag-cite-data.html

Zahvala / AcknowledgementObavezno, ako postoje
        <ack xml:lang="hr"> 
            <title>Zahvale</title>
            <p>Tekst zahvale</p>
        </ack>
 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/ack.html

Dodaci / AppendixObavezno, ako postoje
        <app-group >
            <app xml:lang="hr">
				<title>Appendix</title>
                <p>Tekst appendixa</p>
            </app>
        </app-group>
 

 

https://jats.nlm.nih.gov/publishing/tag-library/1.1/element/app-group.html

  • No labels