Versions Compared
compared with
Key
- This line was added.
- This line was removed.
- Formatting was changed.
Opis
Panel | ||
---|---|---|
| ||
BUSCO (Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs) pruža mjere za kvantitativnu procjenu sklopa genoma, skupa gena i potpunosti transkriptoma na temelju evolucijski informiranih očekivanja sadržaja gena iz gotovo univerzalnih ortologa s jednom kopijom. |
Dostupne verzije
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
5.6.1 | scientific/busco/5.6.1 |
Službena dokumentacija
Primjer
- Primjer je skinut sa
Code Block | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
#!/bin/bash
#PBS -N busco-test
#PBS -l select=1:ncpus=12:mem=20GB
#PBS -q cpu_180
cd $PBS_O_WORKDIR
module load scientific/busco/5.6.1
busco.sh busco -i genome.fna -c $NCPUS -m geno -f --out test_bacteria |