BUSCO (Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs) pruža mjere za kvantitativnu procjenu sklopa genoma, skupa gena i potpunosti transkriptoma na temelju evolucijski informiranih očekivanja sadržaja gena iz gotovo univerzalnih ortologa s jednom kopijom. |
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
5.6.1 | scientific/busco/5.6.1 |
#!/bin/bash #PBS -N busco-test #PBS -l select=1:ncpus=12:mem=20GB #PBS -q cpu cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/busco/5.6.1 busco.sh busco -i genome.fna -c $NCPUS -m geno -f --out test_bacteria |