Opis

BUSCO (Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs) pruža mjere za kvantitativnu procjenu sklopa genoma, skupa gena i potpunosti transkriptoma na temelju evolucijski informiranih očekivanja sadržaja gena iz gotovo univerzalnih ortologa s jednom kopijom.

Dostupne verzije

VerzijaModulSupekPadobran
5.6.1scientific/busco/5.6.1(error) (tick) 

Službena dokumentacija

Primjer

#!/bin/bash

#PBS -N busco-test
#PBS -l select=1:ncpus=12:mem=20GB
#PBS -q cpu

cd $PBS_O_WORKDIR

module load scientific/busco/5.6.1

busco.sh busco -i genome.fna -c $NCPUS -m geno -f --out test_bacteria



  • No labels