...
Warning |
---|
Budući da se zasniva na extended tight‐binding aproksimacijama, za svoje izvršavanje treba funkcionalnosti aplikacije xTB. Iz tog razloga, kako bi koristili određenu verziju CREST-a, trebate učitati i modul željene verzije xTB-a. |
Verzije
CREST verzija |
---|
Preporučena xTB verzija | CREST modul |
---|
Preporučeni xTB modul |
---|
Paralelizacija | Supek | Padobran | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
2.12 | 6.4.0 | scientific/crest/2.12-gnu | scientific/xtb/6.4.0-gnu | OpenMP |
Službena dokumentacija
Primjeri
...
Za uspješno izvršenje aplikacije morate zatražiti jedan računalni čvor, budući da u aplikacija radi s dijeljenom memorijom.
Tip |
---|
xTB CREST će vrijednost |
U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti s 32 OpenMP threada.
Code Block | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#PBS -N run-crest
#PBS -q cpu
#PBS -l ncpus=32
cd ${PBS_O_WORKDIR}
module load scientific/crest/2.12-gnu
module load scientific/xtb/6.6.0-gnu
crest C2H4BrCl-opt.xtbopt.xyz --chrg 0 --uhf 0 --opt vtight --alpb chcl3 |
...