You are viewing an old version of this page. View the current version.

Compare with Current View Page History

« Previous Version 13 Next »

Korištenje

Dostupne verzije su:

VerzijaModul
4.0.1.2orca/4.0.1.2
4.1.2

orca/4.1.2

4.2.0orca/4.2.0


Primjer korištenja:

run-orca-isabella.sge
#!/bin/sh
#$ -N orca-teran
#$ -q p28.q
#$ -pe *mpi 14
#$ -cwd

# load program environment
module load orca/4.0.1.2

# run the program
run-orca-isabella.sh job.inp

Važno

U %PAL sekciji ulazne datoteke job.inp kojom se kontrolira izvođenje paralelnih poslova, "nproc xx" parametar mora odgovarati zatraženom broju slotova/CPU jezgara.

Ako se primjerice zatražilo 14 slotova (#$ -pe *mpi 14), tada se isto mora navesti u ulaznoj datoteci:

%PAL
nproc 14
end

Također, ulazna datoteka job.inp ne bi smjela sadržavati razmake (whitespace) u svom imenu.


Po završetku posla, datoteke *.gbw, *.xyz te *.trj koje je aplikacija generirala/koristila u izvršavanju posla će se spremiti u direktorij iz kojeg je posao pokrenut.

Verzija 4.2.0 sprema sve datoteke koje je aplikacija generirala/koristila kod izvršavanja posla u direktorij iz kojeg je posao pokrenut.

Instalacija

Aplikacija ORCA preuzeta je s https://cec.mpg.de/orcadownload/index.php .

Aplikacija se distribuira u izvršnom obliku te se u verziji 4.0.1.2 oslanja na OpenMPI 2.0.2, a u verziji 4.1.2 i 4.2.0 na OpenMPI 3.1.3.

  • No labels