...
GROMACS je računalno-kemijska aplikacija za molekulsku dinamiku (MD), a prvenstveno se koristi za simulacije makromolekula, kao što su proteini , a te se može se smatrati besplatnom alternativom komercijalnom Amberu.
...
GROMACS je aplikacija otvorenog koda, a podržava hibridnu paralelizaciju, MPI + OpenMP,kao i upotrebu grafičkih procesora koji značajno ubrzavaju MD izračune.
Verzije
| verzija | modul | paralelizacija | red poslova |
|---|---|---|---|
| 2022.5 | scientific/gromacs/2022.5-gnu | MPI + OpenMP | -q cpu |
| 2023 | scientific/gromacs/2023-gnu | MPI + OpenMP | -q cpu |
Službena dokumentacija
...