...
Verzija | Modul |
---|---|
2.3.8 | bioinfo/OrthoFinder/2.3.8 |
2.3.12 | bioinfo/OrthoFinder/2.3.12 |
2.5.4 | bioinfo/OrthoFinder/2.5.4 |
Primjer korištenja
Prilikom pokretanja poslova potrebno je staviti opciju "-t $NSLOTS" kako bi se aplikacija širila prema zatraženom broju CPU jezgara/slotova.
Code Block | ||
---|---|---|
| ||
#!/bin/bash #$ -N test #$ -pe mpisingle 8 #$ -cwd module load bioinfo/OrthoFinder/2.35.84 orthofinder -h |
Testni primjer aplikacije.
...
Code Block |
---|
wget https://github.com/davidemms/OrthoFinder/releases/download/2.3.8/OrthoFinder_glibc-2.15.tar.gz tar -xvf rthoFinderOrthoFinder_glibc-2.15.tar.gz |
Verzija 2.5.4:
Code Block |
---|
source /apps/miniforge3/bin/activate
mamba create -p /apps/virtenv/orthofinder/2.5.4 python=3.8 orthofinder=2.5.4 -c bioconda |