Page History

...

EUKulele je python paket koji omogućuje brzu taksonomsku oznaku metagenomskih i metatranskriptomskih podataka korištenjem pristupa posljednjeg zajedničkog pretka (LCA) za usklađivanje uzoraka s referentnom bazom podataka.

Verzije

Verzija	Modul	Supek	Padobran
2.0.7	scientific/eukulele/2.0.7

Službena dokumentacija

• https://eukulele.readthedocs.io/en/latest/quickstart.html

...

• EUKulele se može koristiti s config datotekom ili komandnom linijomizravno pisati argumente u komandnu liniju.
• no_busco opcija je obavezna jer busco nije instaliran u okolini EUKulele
• svaki DB se mora posebno skidat za korištenje lokalno zbog drugačijeg diamond referenciranja
  • MMETSP
  • PhyloDB
  • EukZoo
  • EukProt

...