...
Preduvjet za instalaciju aplikacije Megalodon jest Guppy basecaller. Potrebni CentOS RPM paket se nalazi na: https://community.nanoporetech.com/downloads . Aplikacija se također povezuje na ZeroMQ biblioteku koja je instalirana iz Software collections repozitorija dodatnih paketa sustava CentOS 7. Sam a aplikacija Megalodon se distribuira se kroz Python paketni sustav PyPI. Na klasteru je instaliran u zasebnom Python virtual environmentu.
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
yum localinstall -y ont-guppy-5.0.11-1.el7.x86_64.rpm
pip3 install numpy
pip3 install ont-pyguppy-client-lib==5.0.11
pip3 install megalodon==2.3.3 |
...