...
Dostupne verzije i pripadajući moduli:
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 4.2.6 | bioinfo/gatk4/4.2.6 |
Primjer korištenja
| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
#!/bin/bash
#$ -N testni_posao
#$ -cwd
#$ -q a12.q 1
module load bioinfo/gatk4/4.2.6
gatk --java-options "-Xmx8G" HaplotypeCaller -R reference.fasta -I input.bam -O output.vcf |
S obzirom da veliki broj alata nema mogućnost kontrole broja jezgara koji se koristi, poslovi se šalju kao serijski.
...