Opis
Modularno rješenje za vizualizaciju, kontrolu kvalitete i taksonomsko dijeljenje skupova podataka genoma
Verzije
| Verzija | Modul | Supek | Padobran |
|---|---|---|---|
| 1.1.1 | scientific/blobtools/1.1.1 |  |  |
Službena dokumentacija
Primjer korištenja
nodesdb je instaliran unutar kontenjera
- primjer je rađen prema: https://github.com/DRL/blobtools
blobtools.pbs
#!/bin/bash #PBS -N blobtools-test #PBS -q cpu cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/blobtools/1.1.1 blobtools.sh blobtools create -i assembly.fna -b mapping_1.sorted.bam -t blast.out -o exam blobtools.sh blobtools view -i exam.blobDB.json blobtools.sh blobtools plot -i exam.blobDB.json