Modularno rješenje za vizualizaciju, kontrolu kvalitete i taksonomsko dijeljenje skupova podataka genoma
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
1.1.1 | scientific/blobtools/1.1.1 |
nodesdb je instaliran unutar kontenjera
#!/bin/bash #PBS -N blobtools-test #PBS -q cpu cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/blobtools/1.1.1 blobtools.sh blobtools create -i assembly.fna -b mapping_1.sorted.bam -t blast.out -o exam blobtools.sh blobtools view -i exam.blobDB.json blobtools.sh blobtools plot -i exam.blobDB.json |