Opis
Muscle v5 može generirati skupine alternativnih poravnanja visoke točnosti. Svi replikati imaju jednaku prosječnu točnost na benchmark testu, uključujući MSA napravljen sa zadanim parametrima. Uspoređujući rezultate nizvodne analize (stabla, predviđanje strukture...) na različitim replikama, možete procijeniti učinke pogrešaka poravnanja na vašu studiju.
Dostupne verzije
| Verzija | Modul | Supek | Padobran |
|---|---|---|---|
| 5.1 | scientific/multiqc/5.1 |  |  |
Službena dokumentacija
Primjer
#!/bin/bash #PBS -N muscle-test #PBS -l select=1:ncpus=12:mem=40GB #PBS -q cpu_180 cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/muscle/5.1 muscle.sh muscle -threads $NCPUS -align test.fa -output alignment.fasta