Dostupne verzije i moduli
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 2.5.1 | bioinfo/SeqKit/2.5.1 |
Korištenje:
- Primjer je rađen na temelju: https://github.com/shenwei356/seqkit/tree/master/benchmark
- Popis toolova: https://github.com/shenwei356/seqkit
Prije pokretanja određenog alata, provjeriti da li ima opciju za određivanje broja threadova ili se serijski pokreće.
#!/bin/bash #$ -N seqkit #$ -cwd #$ -pe *mpisingle 10 module load bioinfo/SeqKit/2.5.1 seqkit seq -j 4 -r -p dataset_A.fa -w 0 > dataset_A.seqkit.rc