You are viewing an old version of this page. View the current version.

Compare with Current View Page History

« Previous Version 10 Next »

Smjernice za dokumentaciju znanstvenih aplikacija.

  • Opis aplikacije - Kratki opis aplikacije(namjena, performanse, usporedba sa prijašnjim verzijama, usporedba sa sličnim aplikacijama)

  • Reference(opt)

  • Službena dokumentacija (glavna stranica aplikacije, github...)

  • Ime modula i verzije

  • Primjer slanja poslova sa schedulerom (primjer skripte, izvor datoteka korištenih za primjer)

  • Napomene (količina korištenih resursa, I/O upozorenja, mogući bugovi, bitni flagovi)
  • Opis dopremanja i instalacije na HPC (korištene knjižnice, prevodioci, putanje, dodatne baze...)
  • Benchmarking(opt)
  • Novosti od verzije do verzije(changelog sa git-a)(opt)

Grupe aplikacija

  • Računalna kemija i fizika čvrstog stanja
    • Molekulska dinamika
      • Gromacs
      • Amber
    • Kvantna mehanika
      • Orca
      • Quantum Espresso
      • xTB
  • Bioinformatika
    • Analiza sekvenca
      • bwa-mem2
      • Mothur
    • Sekvenciranje visoke propusnosti
      • GATK
      • Samtoools
    • Poravnavanje sekvenci
      • ClustalOmega
  • Geofizika
  • Matematika/statistika
  • Machine Learning
  • Dev alati i knjižnice
    • Prevodioci
    • Jezici
    • Knjižnice
    • MPI

Baze podataka

  • Dostupne baze podataka


  • No labels