Aplikacija ORCA preuzeta je s https://cec.mpg.de/orcadownload/index.php .
Aplikacija je već unaprijed kompajlirana u izvršni oblik i linkana na OpenMPI 2.0.2.
Dostupne verzije su:
Verzija | Modul |
---|---|
4.0.1.2 | orca/4.0.1.2 |
Primjer korištenja:
run-orca-isabella.sge
#!/bin/sh #$ -N orca-teran #$ -q p28.q #$ -pe *mpi 14 #$ -cwd # load program environment module load orca/4.0.1.2 # run the program run-orca-isabella.sh job.inp
Važno
U %PAL sekciji ulazne datoteke job.inp
kojom se kontrolira izvođenje paralelnih poslova, "nproc xx
" parametar mora odgovarati zatraženom broju slotova/CPU jezgara.
Ako se primjerice zatražilo 14 slotova (#$ -pe *mpi 14
), tada se isto mora navesti u ulaznoj datoteci:
%PAL nproc 14 end
Također, ulazna datoteka job.inp ne bi smjela sadržavati razmake (whitespace) u svom imenu.
Po završetku posla, datoteke *.gbw
, *.xyz
te *.trj
koje je aplikacija generirala/koristila u izvršavanju posla će se spremiti u direktorij iz kojeg je posao pokrenut.