Instalacija biblioteke Beagle s kompajlerom Intel 2019:
wget -c https://github.com/beagle-dev/beagle-lib/archive/v3.0.2.zip module load intel/2019 CC=icc CXX=icpc FC=ifort F90=ifort ./configure --prefix=/apps/beagle302 make && make install
Dostupne verzije su:
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 1.10 | beast/1.10.2 |
Primjer korištenja:
beast-teran.sge
#!/bin/sh #$ -N beast-teran #$ -q a16.q #$ -pe a16-mpisingle 8 #$ -cwd # load program environment module load beast/1.10.2 # run the program beast -threads $NSLOTS $1
Bitno
Nužno je koristiti paralelne okoline *mpisingle.
Pripremljeni modulefile u varijablu okruženja LD_LIBRARY_PATH dodaje biblioteku Beagle koju će onda aplikacija Beast koristiti u izvršavanju. S navedenom bibliotekom, aplikacija ima bitno bolje performanse.
Podnošenje posla
qsub beast-teran.sge input_datoteka