...
| Code Block | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#!/bin/bash #PBS -N dorado-run-cpu #PBS -l select=1:ncpus=20:mem=200GB #PBS -q cpu cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/dorado/0.6.0 dorado basecaller $MOD/dna_r9.4.1_e8_hac@v3.3 test/ -x "cpu" > test.bam | ||||||
| Code Block | language | bash
| Info | ||
|---|---|---|
| ||
Sa opcijom -x "cpu" Doradu zadamo da koristi obične procesore, znantno je sporije izvođenje posla u odnosu sa grafičkim procesorima i koristi puno radne memorije. |
...