...
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 14-7e284 | bioinfo/MMseqs2/14-7e284 |
Korištenje
Primjer 1.
| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
#!/bin/bash #$ -N mmseq2-test #$ -cwd #$ -pe p28-mpi 8 module load bioinfo/MMseqs2/14-7e284 RUNNER="mpirun -np $NSLOTS" mmseqs easy-search examples/QUERY.fasta examples/DB.fasta alnRes.m8 --threads 1 tmp |
...
| Code Block | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
#!/bin/bash #$ -N mmseq2-test #$ -cwd #$ -pe p28-mpisingle 28 module load bioinfo/MMseqs2/14-7e284 RUNNER="mpirun -np 7" mmseqs easy-search examples/QUERY.fasta examples/DB.fasta alnRes.m8 --threads 4 tmp |
Instalacija
- Korišten je prevodioc gcc/9
- Za mpi je korišten mpi/openmpi41-x86_64
...