Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

xTB je aplikacija otvorenog koda, a podržava OpenMP paralelizaciju što znači da radi s dijeljenom memorijom te se ne može širiti van jednog računalnog čvora.

Verzije

VerzijaModulPodrškaParalelizacijaSupekPadobranverzijamodulparalelizacija
6.4.0scientific/xtb/6.4.0-gnuCPUOpenMPcheck mark button check mark button
6.5.1scientific/xtb/6.5.1-gnuCPUOpenMPcheck mark button (error) 
6.6.0scientific/xtb/6.6.0-gnuCPUOpenMPcheck mark button (error) 

Službena dokumentacija

...

Tip

Kad u zaglavlju PBS skripte definirate vrijednost varijable ncpus, u okolinu se automatski doprema ista vrijednost OMP_NUM_THREADS varijable.

OpenMP

Za uspješno izvršenje aplikacije morate zatražiti jedan računalni čvor, budući da u aplikacija radi s dijeljenom memorijom.

Tip

xTB će vrijednost OMP_NUM_THREADS dobiti po definiranju ncpus varijable u zaglavlju skripte.

U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti s 32 OpenMP threada.

Code Block
languagebash
titleBash skripta
linenumberstrue
#PBS -N run-xtb
#PBS -q cpu
#PBS -l ncpus=32

cd ${PBS_O_WORKDIR}

module load scientific/xtb/6.6.0-gnu

xtb C2H4BrCl.xyz --chrg 0 --uhf 0 --opt vtight --alpb chcl3

...