Table of Contents |
---|
Opis
PARENT je zbirka alata za izračunavanje konfiguracijske entropije iz trajektorija molekulske dinamike.
Otvorenog je koda, a podržava MPI i OpenMP paralelizaciju.
Verzije
Verzija | Modul | Supek | Padobran | Prevodioc | Paralelizacija |
---|---|---|---|---|---|
22.01 |
| GCC | MPI (MPICH) |
Službena dokumentacija
Primjeri
MPI + OpenMP
U primjeru niže, aplikacija će pokrenuti 4 MPI procesa, svaki s 8 OpenMP threadova i 2 GiB RAM.
Code Block | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
#PBS -q cpu
#PBS -l select=4:ncpus=8:mem=2gb
#PBS -j oe
cd ${PBS_O_WORKDIR}
module load "scientific/parent/22.01/mpich-3.4a2/gcc-11.2.1"
bash ${PARENT_DIR}/run.sh parameters |
Primjer možete preuzeti na poveznici.