Opis

PARENT je zbirka alata za izračunavanje konfiguracijske entropije iz trajektorija molekulske dinamike.

Otvorenog je koda, a podržava MPI i OpenMP paralelizaciju. 

Verzije

VerzijaModulSupekPadobranPrevodiocParalelizacija
22.01

scientific/parent/22.01/mpich-3.4a2/gcc-11.2.1

check mark button(error)GCC

MPI (MPICH)

Službena dokumentacija

Primjeri

MPI + OpenMP

U primjeru niže, aplikacija će pokrenuti 4 MPI procesa, svaki s 8 OpenMP threadova i 2 GiB RAM.

PBS skripta
#PBS -q cpu
#PBS -l select=4:ncpus=8:mem=2gb
#PBS -j oe

cd ${PBS_O_WORKDIR}

module load "scientific/parent/22.01/mpich-3.4a2/gcc-11.2.1"

bash ${PARENT_DIR}/run.sh parameters

Primjer možete preuzeti na poveznici.