...
Dostupne verzije i pripadajući moduli:
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 2.2 | bioinfo/bwa-mem2 |
Primjer skripte za opis poslova:
...
| Info | ||
|---|---|---|
| ||
Pri indeksiranju potrebne su velike količine RAM-a stoga se preporuča po izračunu 28GB * N(N je veličina datoteke koja se indeksira). Koristi se -l memory=(količina memorije). Zbog velike količine radne memorije poslovi indeksiranja se šalju isključivo na p20 ili 28. |
Instalacija:
- Compile je izveden sa intel/2020
| Code Block | ||
|---|---|---|
| ||
git clone --recursive https://github.com/bwa-mem2/bwa-mem2
cd bwa-mem2
module load intel/2020
make CC=cc CXX=icpc |