Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Aplikacija ORCA preuzeta je s https://cec.mpg.de/orcadownload/index.php . Aplikacija je vec već unaprijed kompajlirana u izvršni oblik i linkana na OpenMPI 2.0.2.


Dostupne verzije su:

VerzijaModul
4.0.1.2orca/4.0.1.2


Primjer korištenja:

Code Block
titlerun-orca-isabella.sge
#!/bin/sh
#$ -N beast-teran
#$ -q p28.q
#$ -pe *mpi 14
#$ -cwd

# load program environment
module load orca/4.0.1.2

# run the program
run-orca-isabella.sh job.inp

...

Warning
titleVažno

U %PAL sekciji input datoteke job.inp kojom se kontrolira izvođenje paralelnih poslova, "nproc xx" parametar mora odgovarati zatraženom broju slotova/CPU jezgara.

Ako se primjerice zatražilo 14 slotova (#$ -pe *mpi 14), tada se isto mora navesti u input datoteci:


Code Block
%PAL
nproc 14
end



Po završetku posla, datoteke *.gbw, *.xyz te *.trj koje je aplikacija koristila u izvršavanju će se spremiti u direktorij iz kojeg je pokrenut posao.