Preduvjet za instalaciju jest instalacija biblioteke Beagle s kojom aplikacija ima bitno bolje performanse. Instalacija biblioteke je izvršena s kompajlerom Intel 2019:
| Code Block |
|---|
wget -c https://github.com/beagle-dev/beagle-lib/archive/v3.0.2.zip
module load intel/2019
CC=icc CXX=icpc FC=ifort F90=ifort ./configure --prefix=/apps/beagle302
make && make install |
Dostupne verzije su:
| Verzija | Modul |
|---|
| 1.10 | beast/1.10.2 |
Primjer korištenja:
| Code Block |
|---|
|
#!/bin/sh
#$ -N beast-teran
#$ -q a16.q
#$ -pe a16-mpisingle 8
#$ -cwd
# load program environment
module load beast/1.10.2
# run the program
beast -threads $NSLOTS $1 |
| Warning |
|---|
|
Nužno je koristiti paralelne okoline *mpisingle jer je aplikacija paralelizirana dijeljenjem memorije (shared memory parallel model) |
Pripremljeni modulefile u varijablu okruženja LD_LIBRARY_PATH dodaje biblioteku Beagle koju će onda aplikacija Beast koristiti u izvršavanju.
| Code Block |
|---|
|
qsub beast-teran.sge input_datoteka |