...

bwa-mem2 je novija verzija bwa-mem algoritma. Proizvodi poravnavanje (alignment) identično bwa i brži je ~1.3-3.1x ovisno u use-caseu, setu podataka i mašini na kojoj se izvodi.

Verzije

Verzija	Modul	Supek	Padobran
2.2.1	scientific/bwa-mem2/2.2.1

Službena dokumentacija

• https://github.com/bwa-mem2/bwa-mem2
• Datoteke za primjer:
  • SRA: SRR7733443

    
    

    Code Block
    language bash
    fastq-dump --split-files SRR7733443

    
    

  • ref:

    
    

    Code Block
    language bash
    wget http://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/human_g1k_v37.fasta.gz

    
    

...