Versions Compared

Old Version 4

changes.mady.by.user Kristijan Mrkalj

Saved on

compared with

New Version 5

changes.mady.by.user Kristijan Mrkalj

Saved on

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Image Modified

Table of Contents

Opis

CASTEP je aplikacija za simulaciju materijala na atomskoj razini, posebno usmjeren na proučavanje elektronske strukture i svojstava čvrstih tvari.

Warning
titleVažno

Korištenje CASTEP-a ograničeno je na registrirane korisnike.

Više informacija na:

Verzije

VerzijaModulPrevodiocPodrškaParalelizacija *SupekPadobran
19.11scientific/castep/19.11GNUCPUSerijski + MPI(error) check mark button 
20.11scientific/castep/20.11GNUCPUSerijski + MPI(error) check mark button 
21.11scientific/castep/21.11GNUCPUSerijski + MPI(error) check mark button 
22.11scientific/castep/22.11GNUCPUSerijski + MPI(error) check mark button 
Tip
iconfalse

* Svaka od spomenutih verzija ima paralelnu (MPI) verziju te serijsku verziju, budući da neki CASTEP-ovi alati za pred- i postprocesuiranje nisu paralelizirani.

Službena dokumentacija

Primjeri

Note

Ukoliko primijetite sporo izvođenje, preporučuje se korištenje privremenog direktorija TMPDIR. Naime, ponekad input/output (čitanje/pisanje) može biti usko grlo u izvođenju posla.

Prije pokretanja CASTEP-a iz privremenog direktorija, potrebno je tamo premjestiti sve potrebne input datoteke, npr.:

cp -r * ${TMPDIR} && cd ${TMPDIR}

Po završetku izvođenja, potrebno je vratiti nazad željene output datoteke, npr.:

cp -r * ${PBS_O_WORKDIR}

Paralelno izvođenje

Ulazni, tj. input podaci mogu se preuzeti u tarball obliku, direktno sa službenih stranica CASTEP-a. quartz je osnovno ime input datoteka, bez ekstenzija.

U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti na

...

sveukupno 32 procesorskih jezgri, odnosno 4 MPI procesa.

Code Block
languagebash
themeMidnight
titlePBS script
linenumberstrue
#PBS -q cpu
#PBS -l select

...

=2:mpiprocs=16:ncpus=16:mem=48gb
#PBS -l place=pack
export OMP_NUM_THREADS=1

cd ${PBS_O_WORKDIR}

module load scientific/castep/

...

20.11

mpiexec castep.mpi

...

Cu

Serijsko izvođenje

Ulazni, tj. input podaci mogu se preuzeti u tarball obliku, direktno sa službenih stranica CASTEP-a. Si2 je osnovno ime input datoteka, bez ekstenzija.

Code Block
languagebash
themeMidnight
titlePBS skripta
linenumberstrue
#PBS -q cpu

...



cd ${PBS_O_WORKDIR}

module load scientific/castep/

...

20.11

castep.serial Si2