Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Image Modified

Table of Contents

Opis

SHARC je računalno-kemijska aplikacija; ab initio MD programski paket razvijen za proučavanje dinamike pobuđenog stanja molekula.

...

Zbog složenijih ovisnosti, aplikacija je pripremljenu u kontejneru, prilikom čega je za potrebe pod-programa pysharc unutar kontejnera pripremljeno i conda virtualno okruženje.

Verzije

VerzijaModulPodrškaPrevodiocMatematičke knjižnice
3.0.1scientific/sharc/3.0.1-gnuCPUGNU (11.3.0)BLAS, LAPACK, FFTW3

Službena dokumentacija

...

Warning

Potrebno je uskladiti količinu zatraženih resursa (iz PBS skripte) s količinom korištenih resursa u (iz *.resources datoteke).


Code Block
languagebash
titlesharc.pbs
linenumberstrue
#/bin/bash

#PBS -q cpu
#PBS -l ncpus=8

cd ${PBS_O_WORKDIR}

module load scientific/sharc/3.0.1-gnu

export GAUSSIAN="/apps/scientific/gaussian/16-C01/g16"
export SCRADIR="${PBS_O_WORKDIR}/scratch"

sed -i "s,ncpu .*,ncpu ${NCPUS}," QM/GAUSSIAN.resources

sharc-run sharc.x input

...