...
Code Block | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#PBS -q cpu #PBS -l select=8:ncpus=4 #PBS -N gmx MPI_NUM_PROCESSES=$(cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l) cd ${PBS_O_WORKDIR} module load scientific/gromacs/2022.5-gnu mpiexec -n ${MPI_NUM_PROCESSES} -d ${OMP_NUM_THREADS} --cpu-bind depth gmx mdrun -pin on -v -deffnm md |
.MPI
Ako aplikaciju ne želite dijeliti u OpenMP threadove, možete koristiti paralelizaciju isključivo na razini MPI procesa.
...