...
U primjeru niže, aplikacija će stvoriti 2 MPI procesa, pri čemu će svaki koristiti se svakom MPI procesu dodijeliti 1 GPU i 1 CPU jezgrujezgra.
Code Block | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#!/bin/bash #PBS -q gpu #PBS -l select=2:ngpus=1:ncpus=1 #PBS -N run-pmemd MPI_NUM_PROCESSES=$(cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l) cd ${PBS_O_WORKDIR} module load scientific/amber/22-cuda mpiexec -n ${MPI_NUM_PROCESSES} -d ${OMP_NUM_THREADS} --cpu-bind depth \ pmemd.cuda.MPI -O -i md.in -p RAMP1.prmtop -c RAMP1_eq7.rst7 -ref RAMP1_eq7.rst7 -o RAMP1_md.out -r RAMP1_md.rst7 -x RAMP1_md.nc |
...