Page History

...

Primjer korištenja

Prilikom pokretanja poslova potrebno je staviti opciju "-t $NSLOTS" kako bi se aplikacija širila prema zatraženom broju CPU jezgara/slotova.

Code Block

language	bash

#!/bin/bash
#$ -N test
#$ -pe mpisingle 8
#$ -cwd

module load bioinfo/OrthoFinder/2.35.84

orthofinder -h

Testni primjer aplikacije.

...

Code Block
wget https://github.com/davidemms/OrthoFinder/releases/download/2.3.8/OrthoFinder_glibc-2.15.tar.gz tar -xvf OrthoFinder_glibc-2.15.tar.gz

Verzija 2.5.4:

Code Block
source /apps/miniforge3/bin/activate mamba create -p /apps/virtenv/orthofinder/2.5.4 python=3.8 orthofinder=2.5.4 -c bioconda