| Verzija | Modul |
|---|---|
2.7.1a | bioinfo/STAR/2.7.1a |
2.7.10b | bioinfo/STAR/2.7.10b |
Primjer korištenja
Podaci su preuzeti sa : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/data-hub/genome/GCF_000001735.4/
#!/bin/bash #$ -N STAR #$ -cwd #$ -pe *mpisingle 12 module load bioinfo/STAR/2.7.10b STAR --runThreadN 12 --runMode genomeGenerate --genomeDir /index --genomeFastaFiles GCF_000001735.4_TAIR10.1_genomic.fna --sjdbGTFfile genomic.gff --sjdbOverhang 149
Instalacija
- Korišten je prevodioc gcc/9
git clone https://github.com/alexdobin/STAR.git cd STAR/source make STAR