Opis
seqtk je brz i lagan alat za obradu sekvenci u formatu FASTA ili FASTQ. Besprijekorno raščlanjuje i FASTA i FASTQ datoteke koje se također mogu opcionalno komprimirati gzipom.
Verzije
| Verzija | Modul | Supek | Padobran |
|---|---|---|---|
| 1.4 | scientific/seqtk/1.4 |  |  |
Primjer
- seqtk je aplikacija koja koristi jednu dretvu
- https://github.com/lh3/seqtk
seqtk-ex
#!/bin/bash #PBS -N seqtk-test cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/seqtk/1.4 seqtk trimfq R1.fq > out.fq