Opis
Phonopy je softver otvorenog koda za proračune fonona na harmonijskim i kvaziharmonijskim razinama.
Verzije
| Verzija | Modul | Red | Supek | Padobran |
|---|---|---|---|---|
| 2.23.1 | scientific/phonopy/2.23.1 | cpu |  |  |
Phonopy softver nema mogućnost MPI paralelizacije pa je izvođenje posla ograničeno na jedan čvor → select=1.
Službena dokumentacija
Primjer pokretanja posla
Wrapper run_phonopy.sh
Aplikacija phonopy i phonopy alati (phonopy-qha, phonopy-bandplot itd.) pokreću se sa run_phonopy.sh wrapper skriptom.
Primjer je preuzet sa stranice https://github.com/phonopy/phonopy (example/Si).
phonopy_test.pbs
#PBS -N phonopy_test #PBS -q cpu #PBS -l select=1:ncpus=2:mem=5GB module load scientific/phonopy/2.23.1 cd $PBS_O_WORKDIR run_phonopy.sh phonopy -t -p mesh.conf