Opis
Elk je aplikacija fizike čvrstog stanja, koja koristi FP-LAPW metodu za proračun elektronskih svojstava materijala unutar teorija funkcionala gustoće (DFT). Koristi se za analizu elektronske strukture, energija, gustoća stanja i drugih fizikalnih svojstava materijala.
Elk je otvorenog koda, a podržava hibridnu paralelizaciju, MPI + OpenMP.
Verzije
| Verzija | Modul | Podrška | Paralelizacija | Supek | Padobran |
|---|---|---|---|---|---|
| 10.1.15 | scientific/elk/10.1.15 | CPU | MPI + OpenMP |  |
Službena dokumentacija
Primjeri
Kad u zaglavlju PBS skripte definirate vrijednost varijable ncpus, u okolinu se automatski doprema ista vrijednost OMP_NUM_THREADS varijable.
U primjeru niže, aplikacija će se pokrenuti s 4 MPI procesa i 2 OpenMP threada po MPI procesu.
Bash skripta
#PBS -q cpu
#PBS -l select=4:ncpus=2:mem=4gb
#PBS -j oe
export OMP_PROC_BIND="true"
cd ${PBS_O_WORKDIR}
module load "scientific/elk/10.1.15"
mpirun --map-by SLOT:PE=${OMP_NUM_THREADS} elk