Prijenos na Galaxy
U korisničkom sučelju:
Otvara izbornik:
- Choose local files - upload lokalno sa računala
- Paste/Fetch data - upload datoteka sa linka:
Prijenos datoteka sa Padobrana
U Galaxy sučelju se generira API key:
- User → Preferences → Manage Api Key
Stvorimo novi key:
Kopiramo stvoreni key:
Primjer prijenosa datoteka sa padobrana
Primjer uploada sa Padobrana na Galaxy
#Učitamo modul za galaxy-upload module load utils/galaxy-upload/1.0.1 #Učitamo varijablu za api key export GALAXY_API_KEY=(ovdje ide vaš generirani api key) #Prebacimo se u željeni direktorij cd bio_data #Upload naredba se sastoji od galaxy-upload naredbe, ime history-a ili id historya u koji se učitavaju datoteke # i ime datoteke #Pretraživanje informacija o dostupnim povijesnim sekcijama galaxy-search-history #Učitavanje datoteke u Galaxy galaxy-upload –-history-name (ime povijesne sekcije) ERR022075_1.fastq #ili galaxy-upload –-history-id (id povijesne sekcije) ERR022075_1.fastq #Za više informacija galaxy-upload --help