Na klasteru je dostupan program MrBayes verzija 3.2.7a. Dostupan je kroz modul:
| Verzija | Modul |
|---|---|
| 3.2.7a | mrbayes/3.2.7a |
Pokretanje programa:
Korištenje aplikacije
#$ -pe *mpi 2 module load mrbayes/3.2.7a mpirun -np $NSLOTS mb IME_DATOTEKE_S_PODACIMA.nex
Uz aplikaciju dolazi nekoliko primjera koje je moguće kopirati s lokacije :
Lokacija primjera
/apps/mrbayes/3.2.7a/intel_2019_openmpi31-intel-x86_64/avx512/share/examples/mrbayes/
dok je s lokacije:
Lokacija uputa za koristenje
/apps/mrbayes/3.2.7a/intel_2019_openmpi31-intel-x86_64/avx512/share/doc/mrbayes/Manual_MrBayes_v3.2.pdf
moguće dohvatiti .pdf verziju uputa za korištenje.
Više o samom programu moguće je pročitati na mrežnim stranicama.
Aplikacija je instalirana koristeći mpicc 3.1.4 kompaljer, te je povezana na knjižnicu BEAGLE v3.1.2.
Instalacija
git clone --depth=1 https://github.com/NBISweden/MrBayes.git module load intel/2019 module load mpi/openmpi31-intel-x86_64 C=/opt/openmpi-intel/3.1.4/bin/mpicc ./configure --with-mpi=yes --with-beagle=/apps/beagle312 --prefix=/apps/mrbayes/3.2.7a/intel_2019_openmpi31-intel-x86_64/avx512/bin/mb make make install