Dostupne verzije i pripadajući moduli:
Verzija | Module |
---|---|
5.7.8 | bioinfo/ASTRAL/5.7.8 |
Korištenje
- Primjer je preuzet sa gita: https://github.com/smirarab/ASTRAL
#!/bin/bash #$ -N astral #$ -cwd #$ -pe *mpisingle 2 module load bioinfo/ASTRAL/5.7.8 ASTRAL -i song_mammals.424.gene.tre -o out.tre 2>out.log
U slučaju veććih podataka i potrebe za više radne memorije:
#!/bin/bash #$ -N astral_more_mem #$ -cwd #$ -pe *mpisingle 2 #$ -l memory=4 module load bioinfo/ASTRAL/5.7.8 java -Xmx8000M -jar $astral/astral.5.7.8.jar -i song_mammals.424.gene.tre -o out.tre 2>out.log