Općenito
NWChem pruža računalno-kemijske alate koji se mogu skalirati i do tisuće procesorskih jezgri te je s toga prikladan za korištenje na naprednim računalnim resursima.
Posjeduje mogućnost rada s biomolekulama, nanostrukturama i čvrstim stanjem, s osnovnim i pobuđenim stanjima, može predviđati svojstva i relativističke efekte te drugo.
Verzija NWChem-a dostupna na računalnom klasteru Isabella kompajlirana je Intelovim C/C++ i Fortran kompajlerima te koristi Open MPI knjižnice.
Moduli
Moduli koji dopremaju NWChem u vašu okolinu definirani su u tablici niže:
Verzija | Modul |
7.0.2 | nwchem/7.0.2 |
Primjer korištenja - paralelno izvođenje
Ulazne tj. input podatke za primjer niže možete preuzeti u obliku .nw datoteke.
run.sge
#!/bin/bash #$ -N nwchem #$ -cwd #$ -pe *mpi 20 #$ -l memory=2 export OMP_NUM_THREADS=1 module load nwchem/7.0.2 mpirun -np ${NSLOTS} nwchem Input_c240_pbe0.nw
Vrijeme za izvođenje ovog posla u paralelnoj okolini navedenoj u zaglavlju skripte iznosi oko 1 h i 50 minuta.