Svaki korisnik može vidjeti profile drugih korisnika u e-kolegiju. Odabirom imena željenoga korisnika iz popisa svih sudionika ili korisnika koji su trenutačno online ostvaruje se pristup korisničkomu profilu. Sustav omogućava izravno slanje poruke drugome korisniku odabirom poveznice Poruka u profilu te osobe ili ikone 
u popisu korisnika koji su trenutačno online.
Dolazne poruke vidljive su na traci s izbornicima pored ikone 
(Poruke). Prikazan je broj primljenih poruka, a odabirom ikone pristupa se pretincu za poruke. U pretincu su dostupne tri sekcije:
- sekcija u kojoj se nalaze poruke korisnika koje su označene zvjezdicom
- sekcija u kojoj se nalaze grupne poruke
- sekcija u kojoj se nalaze privatne poruke
Odabirom poveznice Prikaži sve pretinac za poruke koji se zadano otvara u stupcu uz desni rub zaslona moguće je proširiti preko cijelog zaslona, podijeljeno u dva stupca.
Ako korisnik kojem se šalje poruka u trenutku slanja nije prijavljen u sustavu, poruka će, sukladno zadanim postavkama, biti poslana i na adresu e-pošte.
Postavke vezane uz način dostavljanja primljenih poruka moguće je mijenjati odabirom mogućnosti Postavke → Postavke poruka iz korisničkog izbornika osobnoga profila, smještenoga na traci s izbornicima. U postavkama korisnik može ograničiti tko će mu moći poslati poruku (samo njegovi kontakti ili njegovi kontakti i svi sudionici u njegovim e-kolegijima).
Korisnik može postaviti da mu obavijesti o pristiglim porukama pristižu putem adrese e-pošte ili kao obavijest na mobilni uređaj ovisno o tome nalazi li se ili ne nalazi trenutačno u sustavu.
Postavke poruka
Arhiva poruka dostupna je u traci s izbornicima odabirom ikone 
(Poruke). Odabirom pojedinoga korisnika može se pregledati povijest razgovora.
Unutar sekcije u kojoj se nalaze poruke korisnika koje su označene zvjezdicom, odabirom vlastitog imena i prezimena korisniku je dostupan i osobni prostor za pohranu bilješki, podsjetnika, korisnih poveznica i sl.
Osobni prostor u pretincu za poruke
Dodatne mogućnosti vezane uz kontakte
Odabirom tri točkice pokraj imena kontakta korisniku je dostupno nekoliko dodatnih mogućnosti (npr. može ga dodati u svoje kontakte, označiti zvjezdicom, blokirati, izbrisati razgovor ili privremeno isključiti poruke (Mute)).
Unutar sustava Merlin moguće je slanje poruke samo jednome sudioniku e-kolegija, slanje grupnih poruka ili slanje iste poruke većem broju korisnika.
Pojedinačne poruke
Poruka se šalje drugim sudionicima kroz njihov profil (za nove razgovore) ili odabirom ikone 
(Poruke) u traci s izbornicima (za nastavak prijašnjih razgovora). Svaki korisnik može vidjeti profile drugih korisnika u e-kolegiju i to na više mjesta u sustavu:
- u bloku Korisnici online
- odabirom bloka Administracija → Administracija e-kolegija → Korisnici → Sudionici (samo nastavnici)
- odabirom poveznice Sudionici unutar padajućega izbornika Sadržaj na traci s izbornicima
Odabirom imena željenoga korisnika ostvaruje se pristup korisničkomu profilu. Sustav omogućava izravno slanje poruke drugome korisniku odabirom poveznice Poruka u profilu te osobe ili ikone 
(Pošalji poruku) u popisu korisnika i bloku Korisnici online . Poruka se može poslati i korisnicima koji nisu upisani u e-kolegij ili trenutno nisu online u sustavu, odabirom poveznice Arhiva poruka iz padajućeg izbornika osobnoga profila te pretraživanjem korisnika odabirom poveznice Kontakti. U slučaju prethodne komunikacije, istoj se pristupa odabirom ikone 
(Poruke) na traci s izbornicima.
Slanje iste poruke većem broju korisnika e-kolegija
Poveznica na popis svih korisnika upisanih u e-kolegij nalazi se na traci s izbornicima u padajućem izborniku Sadržaj ili odabirom Administracija → Administracija e-kolegija → Korisnici → Sudionici.
Kroz popis sudionika nastavniku je omogućeno slanje iste poruke većem broju korisnika e-kolegija.
Nakon odabira korisnika potrebno je u padajućem izborniku S odabranim korisnicima odabrati Pošalji poruku.
Odabir korisnika kojima će poruka biti poslana
Ako je e-kolegij podijeljen u grupe, u polje za pretraživanje moguće je upisati naziv željene grupe te nakon njenog odabira poslati poruku samo članovima te grupe.
Brisanje poruka
Brisanje poruka
Za brisanje poruka potrebno je odabrati poveznicu Uredi smještenu u gornjem desnom kutu sučelja za poruke, zatim označiti poruku koju želite izbrisati te odabrati poveznicu Izbiši označene poruke.
Poruka koju korisnik izbriše bit će izbrisana samo iz njegove arhive poruka dok će ona i dalje biti vidljiva ostalim korisnicima koji su primili tu poruku.
Obavijesti
Obavijesti korisniku ukazuju na neke događaje u e-kolegiju (npr. informacija o predaji zadaće, povratna informacija vezana uz predanu zadaću, nova poruka u forumu, obavijest o zakazanom dijalogu, dodjela značke i sl.).
Ikona 
(Obavijesti) smještena je na traci s izbornicima pored ikone 
(Poruke). Prikazan je broj primljenih obavijesti, a odabirom ikone vidljiv je naslov događaja na koji se obavijest odnosi.
Korisnik može sve obavijesti označiti kao pročitane odabirom ikone 
, urediti postavke primanja obavijesti odabirom ikone 
, prikazati sve obavijesti odjednom odabirom poveznice Prikaži sve ili odabrati pojedinu obavijest za prikaz punog sadržaja.
Obavijesti
