Dostupne verzije su:
Verzija | Modul |
---|---|
2019.1 | qiime2/qiime2-2019.1 |
2019.4 | qiime2/qiime2-2019.4 |
2019.10 | qiime2/qiime2-2019.10 |
2021.2 | qiime2/qiime2-2021.2 |
Primjer korištenja:
#!/bin/bash #$ -N qiime-test #$ -cwd module load qiime2/qiime2-2019.X source activate qiime2-2019.X qiime --help source deactivate
Instalacija
QIIME2 je instaliran unutar conda virtualnog okruženja.
Instalacija Miniconde:
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Kreiranje conda virtualnog okruženja:
wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2019.1-py36-linux-conda.yml conda env create -n qiime2-2019.1 --file qiime2-2019.1-py36-linux-conda.yml