Izgled korisničkoga sučelja sličan je u cijelome sustavu i sastoji se od dva stupca. Lijevi stupac sadrži blokove, a u središnjemu je dijelu prikazan sadržaj e-kolegija organiziran kroz teme ili tjedne.
Prikaz sučelja sustava Merlin
Zaglavlje
Traka s izbornicima
Navigacijska traka
Blok
Lijevi stupac
Središnji dio
Svaki korisnik može urediti izgled sučelja po želji i organizirati sadržaj u tri stupca. Nakon prijave u sustav korisnik može odabrati dugme Omogući izmjene te pomoću ikone 
(Premjesti) premjestiti odabrani blok na željeno mjesto u desnom stupcu sučelja.
Traka s izbornicima
Traka s izbornicima
Na traci s izbornicima smješteni su sljedeći padajući izbornici:
- Rad na sustavu – sadrži poveznice na priručnike i animacije, zahtjev za otvaranje e-kolegija, poveznice na tečajeve i radionice, arhivu e-kolegija itd.
- Helpdesk – sadrži kontakt podatke Centra za e-učenje i poveznicu na najčešće postavljena pitanja.
- Moji e-kolegiji – sadrži popis e-kolegija u koje je korisnik upisan.
- Sadržaj – sadrži poveznicu na popis sudionika u e-kolegiju, ocjene te aktivnosti i resurse u e-kolegiju.
Na traci je smještena i ikona za pretraživanje, poveznice na poruke korisnika , promjenu jezika sučelja te korisnički izbornik osobnoga profila.
Navigacijska traka
Navigacijska traka
Navigacijska traka (breadcrumbs) prikazuje trenutačni položaj u sustavu te omogućuje jednostavnije kretanje po sustavu i lakše vraćanje na hijerarhijski više stranice.
Korisničke ture
Korisničke ture su izrađene kao kratki vodič kroz novosti na sustavu Merlin. Prikazuju se pri prvom dolasku korisnika na sustav, a dostupna je mogućnost ponovnog prikaza odabirom poveznice Pokreni korisničku turu na ovoj stranici smještene na dnu stranice na kojoj se korisnička tura nalazi.
Prikaz korisničke ture
