Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Korištenje

Dostupne verzije su:

VerzijaModul
1.2.2bagel/1.2.2


Primjer skripte za opis poslova:

...

Warning
titleVažno

Aplikacija bagel se može širiti hibridno MPI procesima i MKL threadovima gdje svaki MPI proces može pokrenuti nekoliko MKL threadova. To znači da se vrijednosti parametara MKL_NUM_THREADS te -np (number of processes) mogu varirati, samo u tom slučaju je potrebno paziti da je njihov umnožak jednak broju zatraženih CPU slotova/jezgara.


Instalacija

Preduvjet za instalaciju aplikacije bagel jeste instalirana biblioteka boost. Biblioteka je instalirana u verziji 1.70 te je kompajlirana kompajlerom GCC-7.3.1 i MPI implementacijom mvapich-2.3. Kompajler gcc u verziji 7.3.1 je na klaster Isabella instaliran iz Software Collections repozitorija dodatnih paketa sustava CentOS 7. Tijek instalacije:

Code Block
titleOtpakiranje i priprema
wget -c https://dl.bintray.com/boostorg/release/1.70.0/source/boost_1_70_0.tar.bz2
tar -xjf tar -xjf boost_1_70_0.tar.bz2 && cd boost_1_70_0
scl enable devtoolset-7 './bootstrap.sh --with-toolset=gcc --prefix=/apps/boost/1.70/avx2'


U datoteku project-config.jam, na kraj je potrebno dodati:

Code Block
titleBoost MPI
using mpi ;


Code Block
titleKompajliranje boost biblioteke
scl enable devtoolset-7 './b2 -j8 -a'
scl enable devtoolset-7 './b2 install'