Opis
HERRO (Haplotype-aware ERRor Correction) vrlo je precizan, haplotip alat za duboko učenje za ispravljanje pogrešaka Nanopore R10.4.1, Kit 14 očitavanja (preporučuje se duljina od ≥ 10000 bp).
Dostupne verzije
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
0.1.0 | scientific/herro/0.1.0 |
Službena dokumentacija
Primjer korištenja
- Primjer je napravljen prema: https://github.com/lbcb-sci/herro
- Testni podaci: https://labs.epi2me.io/gm24385_ncm23_preview/
...
- 2 modela su dostupna pod varijablom $MODELS
- model_R9_v0.1.pt(eksperimentalni)
- model_v0.1.pt
...