...
Bowtie 2 je ultrabrz i memorijski učinkovit alat za usklađivanje čitanja sekvenciranja s dugim referentnim sekvencama. Osobito je dobar u usklađivanju čitanja od oko 50 do 100 ili 1000 znakova, a posebno je dobar u usklađivanju s relativno dugim genomima (npr. sisavaca). Bowtie 2 indeksira genom s FM indeksom kako bi njegov memorijski otisak bio mali: za ljudski genom njegov memorijski otisak obično je oko 3,2 GB. Bowtie 2 podržava načine poravnanja s praznim, lokalnim i uparenim krajevima.
Verzije
Verzija | Modul | Supek | Padobran |
---|---|---|---|
2.5.1 | scientific/bowtie2/2.5.1 |
Službena dokumentacija
https://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml
...