Prijenos na Galaxy
U korisničkom sučelju:
Otvara izbornik:
- Choose local files - upload lokalno sa računala
- Paste/Fetch data - upload datoteka sa linka:
Prijenos datoteka sa Padobrana
U Galaxy sučelju se generira API key:
- User → Preferences → Manage Api Key
Stvorimo novi key:
Kopiramo stvoreni key:
Na Padobranu napravimo sljedeće:
| Code Block | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#Učitamo modul za galaxy-upload module load utils/galaxy-upload/1.0.1 #Učitamo varijablu za api key export GALAXY_API_KEY=#ovdje ide vaš generirani api key #Prebacimo se u željeni direktorij cd bio_data #Upload naredba se sastoji od galaxy-upload naredbe, ime history-a ili id historya u koji se učitavaju datoteke # i ime datoteke galaxy-upload --history-name mapiranje ERR022075_1.fastq #Za više informacija galaxy-upload --help |