...
- Parno poravnanje proteina i prevedene DNK brzinom 100x-10 000x od BLAST-a.
- Proteinsko grupiranje do desetaka milijardi proteina
- Poravnanja pomaka okvira za analizu dugog čitanja.
- Mali zahtjevi za resursima i pogodan za rad na standardnim stolnim ili prijenosnim računalima.
- Različiti izlazni formati, uključujući BLAST u paru, tablični i XML, kao i taksonomsku klasifikaciju.
Dostupne verzije:
| Verzija | Modul | Supek | Vrančić(Padobran) |
|---|---|---|---|
| 2.1.8 | scientific/DIAMOND/2.1.8 |  |  |
Primjer korištenja:
| Code Block | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
#!/bin/bash #PBS -N dmd-cluster #PBS -l select=1:ncpus=12:mem=64GB #PBS -q cpu cd $PBS_O_WORKDIR module load scientific/DIAMOND/2.1.8 diamond cluster -d astral-scopedom-seqres-gd-sel-gs-bib-95-2.07.fa -o clusters.tsv --approx-id 40 --threads $NCPUS --memory-limit 64G --header |
...