Table of Contents |
---|
Opis
Molden je besplatna aplikacija za vizualizaciju molekularnih struktura u računalnoj kemiji.
Podržava različite formate datoteka, uključujući Gaussian, GAMESS i druge, a omogućuje prikaz molekulskih orbitala, elektronske gustoće, vibracijskih modova itd. Također ima mnoge alate za prilagodbu prikaza i analizu podataka.
Službena dokumentacija
Verzije
Verzija | Modul | Podrška | Supek | Padobran |
---|---|---|---|---|
6.9 | scientific/molden/6.9 | CPU |
Napomene
Warning |
---|
Kako bi se aplikacija uspješno pokrenula, potrebno je spojiti se na pristupni čvor uz prosljeđivanje X11. U slučaju korištenja Linuxa ili macOS-a, koristite naredbu:
U slučaju korištenja Windowsa, potrebno je preuzeti aplikaciju Xming te je pokrenuti prije pokretanja PuTTY-ja. Unutar PuTTY-ja, potrebno je uključiti X11 forwarding (Connection → SSH → X11, Enable X11 forwarding). |
Primjer korištenja
Code Block | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
module load scientific/molden/6.9 |
Code Block | ||||
---|---|---|---|---|
| ||||
gmolden azithromycin.xyz |