Versions Compared

Old Version 21

changes.mady.by.user Kristijan Mrkalj

Saved on

compared with

New Version 22

changes.mady.by.user Kristijan Mrkalj

Saved on

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

VerzijaModulPodrškaParalelizacijaDostupnost
SupekPadobran
4.2.1scientific/orca/4.2.1CPUMPI *check mark button (error)
5.0.3scientific/orca/5.0.3CPUMPI *check mark button (error) 
5.0.4scientific/orca/5.0.4CPUMPI *check mark button check mark button 
Warningnote
title Napomena *

ORCA dolazi u obliku prekompajliranih izvršnih datoteka koje se povezuju na Open MPI knjižnice.

...

Warning

Zbog nemogućnosti Open MPI-ja da iskoristi puni potencijal Supekove Slingshot mreže, odnosno nemogućnosti širenja van jednog čvora u slučaju Padobrana, potrebno je aplikaciju zadržati unutar granica jednog čvora, koristeći PBS opciju:

#PBS -l place=pack

Warning

Postavke ORCA simulacije, koje uključuju i broj procesorskih jezgri te radne memorije, definiraju se u ulaznoj ORCA .inp datoteci.

Budući da aplikacija ne komunicira direktno s PBS sustavom, važno je osigurati da količina resursa u toj datoteci odgovara količini zatraženih resursa u zaglavlju PBS skripte kako ne bi došlo do diskrepancije.

...

Warning

ORCA-ina varijabla MaxCore (definirana u input datoteci) predstavlja memorijsko ograničenje određenih ORCA-inih računskih funkcija. Premala vrijednost za složenije sustave može rezultirati prekidom izvođenja posla. Tako primjerice %MaxCore 4000 postavlja ograničenje od 4000 MB (4 GB) i primjenjuje se po procesorskoj jezgri.

Međutim, program može i zauzeti više od toga pa se savjetuje koristiti broj koji je oko 75% zatražene memorije (po selectu) u zaglavlju PBS skripte.

...